Affymetrix Canine Genome 2.0 Array 狗
该芯片可以检测18,000个犬的mRNA/EST转录子，和超过20,000个非冗余的预测基因。
GeneChip Rat Exon 1.0ST Array 大鼠外显子芯片
大鼠全转录本表达谱芯片，约有4个探针来针对每个外显子 / 约有40个探针来针对每个基因，覆盖经验性及预测的外显子序列，约850000个外显子。可用于基因表达和可变剪切分析。
癌通路发现者基因表达PCR芯片
癌症通路发现者基因表达PCR芯片可用于研究在肿瘤发生和转移过程中，该芯片包含了9个与癌症相关的重要信号通路的基因，通过实时定量PCR的方法，研究者即能够利用该芯片简单可靠地同时检测肿瘤发生和转移过程中标志基因的表达，研究各种肿瘤细胞通路的活性状况。
Affymetrix Rhesus Macaque Genome Array 恒河猴
恒河猴基因芯片组点可以检测2004年10月前报道的Genbank, dbEST 和Unigene数据库中的47000个转录子，以及一些相关病毒的基因。
GeneChip Mouse Exon 1.0ST Array 小鼠外显子芯片
小鼠全转录本表达谱芯片，约有4个探针来针对每个外显子 / 约有40个探针来针对每个基因，覆盖经验性及预测的外显子序列，约1000000个外显子。可用于基因表达和可变剪切分析。